毛細管柱的相比約為填充柱的數(shù)十倍。由于液膜極薄,分配比k很小，相比大，組分在固定相中的傳質(zhì)速度極快,因此有利于提高柱效和分析速度。它可在1小時內(nèi)分離出包含一百多種化合物的汽油成分；可在幾分鐘內(nèi)分離十幾個化合物。
　　
　　一般將毛細管柱分為四種類型：壁涂開管柱（WCOT）、載體涂漬開管柱（SCOT）、交聯(lián)毛細管柱(CLOT）和多孔層開管柱（PLOT）。經(jīng)典的毛細管柱為壁涂開管柱管內(nèi)經(jīng)預處理后將固定液直接涂漬在內(nèi)壁上。因其制備難、柱子的重復性差、內(nèi)表面小、涂漬量小和相比β值大，將導致有效塔板數(shù)和實際分離能力不高，且熱穩(wěn)定性也較差，已很少使用。
　　
　　毛細管柱內(nèi)徑一般為0.1~0.7mm,內(nèi)壁固定液膜極薄,中心是空的,因阻力很小,而且渦流擴散項不存在,譜帶展寬變小.由于毛細管柱的阻力很小,長可為填充柱的幾十倍,其總柱效比填充柱高得多。
　　
　　毛細管柱長短直接影響到保留時間和分離效率。實驗室應用的色譜柱長多為5m、7.5m、10m、12.5m、15m、25m、30m、50m、60m、75m、100m和105m等。常見的色譜柱長度是30m。
　　
　　對于快速分析來說，除了選擇適當?shù)膬?nèi)徑，柱長度也短許多（例如5～15m×0.25mm）。只有這樣，才有可能在短的時間內(nèi)，得到佳的分離效果和分析結(jié)果。
　　
　　如果方法需要改進提高分辨率，較長的色譜柱，如60m或100m，是理想的選擇。分辨率與柱長的平方根成正比。需要注意的是，像一根60m長的色譜柱相對于30m的柱子，其分辨率提高近40%，但分析時間會成倍增長。
　　
　　在揮發(fā)物的分析應用中，為了改善分離效果，常使用較長的柱型，如50m、60m和100m等。在氣態(tài)樣品和精細烴分析應用中，較長色譜柱的使用較為普遍。
　　
　　更長的色譜柱會影響柱惰性、柱流失和柱效等多個方面。同時，需要更高的載氣壓力或更換載氣的種類（如把氮氣更換成氫氣/氦氣）。